RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 TTLL6Q8N841 843 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 USP16Q9Y5T5 823 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 NFKBIEO00221 500 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 RIPK4P57078 832 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 SERPINB2P05120 415 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 POTECB2RU33 542 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 H0YIN7 160 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 NPHP1O15259 732 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 RUNDC1Q96C34 613 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 BCORQ6W2J9 1755 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 SETDB2Q96T68 719 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 CAMTA2O94983 1202 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 NEUROD2Q15784 382 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPNS2-204ENST00000571386 ERFEQ4G0M1 354 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 CREBZFQ9NS37 354 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 NBPF26B4DH59 902 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 NBPF15Q8N660 670 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 CNBD1Q8NA66 436 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 SLX4Q8IY92 1834 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 SCN4AP35499 1836 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 RGL2O15211 777 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 C21orf2O43822 256 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 PDE6BP35913 854 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 ST5P78524 1137 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 CHADLQ6NUI6 762 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 POTEIP0CG38 1075 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 POTEJP0CG39 1038 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 NGEFQ8N5V2 710 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 CNTNAP1P78357 1384 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-204ENST00000571386 ERBB4Q15303 1308 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 FOXN1O15353 648 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 MYL6BP14649 208 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 PASKQ96RG2 1323 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 CHL1O00533 1208 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 ANP32CO43423 234 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-204ENST00000571386 NUP98P52948 1817 aa21.64■■□□□ 1.06
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SPNS2-204ENST00000571386 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 HLFQ16534 295 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 LDHDQ86WU2 507 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 FAM177BA6PVY3 158 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 APAF1O14727 1248 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 CNKSR1Q969H4 720 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 AIDAQ96BJ3 306 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 SOGA3Q5TF21 947 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 STYK1Q6J9G0 422 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 NYXQ9GZU5 481 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS2-204ENST00000571386 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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