RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561718.5

RNPS1-205, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-205ENST00000561718 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-205ENST00000561718 GCKRQ14397 625 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-205ENST00000561718 ATG3Q9NT62 314 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-205ENST00000561718 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.27■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 CDC45O75419 566 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 COL15A1P39059 1388 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 STARD3NLO95772 234 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 A1BGP04217 495 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 PDE1AP54750 535 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 SUCLG2Q96I99 432 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 AOX1Q06278 1338 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 BCL11AQ9H165 835 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 MX1P20591 662 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 KAZALD1Q96I82 304 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 STAP2Q9UGK3 403 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-205ENST00000561718 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 VPS72Q15906 364 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 CERKQ8TCT0 537 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 NGLY1Q96IV0 654 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 CASC1Q6TDU7 716 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 SDSP20132 328 aa22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 C8orf37Q96NL8 207 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 TJP1Q07157 1748 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 A0A087WZG4 1122 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 BECN1Q14457 450 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-205ENST00000561718 H7C1W4 665 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 CASP7P55210 303 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 TCIRG1Q13488 830 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 COPRSQ9NQ92 184 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 GPATCH3Q96I76 525 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 USP21Q9UK80 565 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 AK9Q5TCS8 1911 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.08■■□□□ 1.13
RNPS1-205ENST00000561718 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
RNPS1-205ENST00000561718 RREB1Q92766 1687 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-205ENST00000561718 REC8O95072 547 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-205ENST00000561718 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-205ENST00000561718 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-205ENST00000561718 A0A0G2JS52 829 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-205ENST00000561718 ERC2O15083 957 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-205ENST00000561718 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms