RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.78■■□□□ 1.72
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.78■■□□□ 1.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGL2O15211 777 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLRG1Q96E93 195 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MASTLQ96GX5 879 aa25.77■■□□□ 1.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTRA3P83110 453 aa25.76■■□□□ 1.71
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF26B4DH59 902 aa25.74■■□□□ 1.71
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF15Q8N660 670 aa25.74■■□□□ 1.71
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.71■■□□□ 1.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.71■■□□□ 1.71
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCORQ6W2J9 1755 aa25.69■■□□□ 1.7
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.68■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.68■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.67■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLX4Q8IY92 1834 aa25.67■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCNTO95613 3336 aa25.66■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLFQ16534 295 aa25.65■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC93Q567U6 631 aa25.65■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.65■■□□□ 1.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM177BA6PVY3 158 aa25.63■■□□□ 1.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.63■■□□□ 1.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NFE2L2Q16236 605 aa25.63■■□□□ 1.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALDH1B1P30837 517 aa25.62■■□□□ 1.69
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NGEFQ8N5V2 710 aa25.61■■□□□ 1.69
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.58■■□□□ 1.69
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.58■■□□□ 1.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.58■■□□□ 1.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.56■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CACNA1SQ13698 1873 aa25.55■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYL6BP14649 208 aa25.55■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRY2Q49AN0 593 aa25.55■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OLFM4Q6UX06 510 aa25.55■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.53■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.53■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYNE4Q8N205 404 aa25.53■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERBB4Q15303 1308 aa25.53■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.53■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POTEIP0CG38 1075 aa25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POTEJP0CG39 1038 aa25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LDHDQ86WU2 507 aa25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CREBZFQ9NS37 354 aa25.52■■□□□ 1.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.51■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.51■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPTP24298 496 aa25.5■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUSD4Q5VX71 490 aa25.5■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.5■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC12Q96J65 1359 aa25.5■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMD1Q99460 953 aa25.5■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.49■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FZD9O00144 591 aa25.49■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIPK4P57078 832 aa25.49■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.49■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.49■■□□□ 1.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.48■■□□□ 1.67
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