RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	BIRC3	Q13489	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ITGAE	P38570	1179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TRPC1	P48995	793 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MCM10	Q7L590	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TBX3	O15119	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	VCAM1	P19320	739 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	DNAJC6	O75061	913 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	GRM1	Q13255	1194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	RASA3	Q14644	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	BHMT	Q93088	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPY1	Q01534	308 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	BPNT1	O95861	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TAF11	Q15544	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM212A	Q96EL1	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483		H0Y3Z8	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PRPH	P41219	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM37	O94972	964 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TMED1	Q13445	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GNAL	P38405	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	USP6NL	Q92738	828 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TNNI2	P48788	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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