RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 PSMD1Q99460 953 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 DCTPP1Q9H773 170 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 FEZ1Q99689 392 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 SKAP1Q86WV1 359 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 GBP3Q9H0R5 595 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CENPHQ9H3R5 247 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CDC45O75419 566 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 RABEP1Q15276 862 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRD-214ENST00000540109 TICAM2Q86XR7 235 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 AOX1Q06278 1338 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CAVIN2O95810 425 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ATF3P18847 181 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 RGS12O14924 1447 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 NUTM2FA1L443 756 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-214ENST00000540109 TSPYL6Q8N831 410 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 INCENPQ9NQS7 918 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ERLIN1O75477 346 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 GNAI2P04899 355 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 REC8O95072 547 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 FAM177BA6PVY3 158 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 TUBBP07437 444 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 NEFHP12036 1026 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 MCM10Q7L590 875 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-214ENST00000540109 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ALS2Q96Q42 1657 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ATP10DQ9P241 1426 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC4A2P04920 1241 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 SNX21Q969T3 373 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 TNNQ9UQP3 1299 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRD-214ENST00000540109 DDX11Q96FC9 970 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 FAM83GA6ND36 823 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 SETSIPP0DME0 302 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 FBLN1P23142 703 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 MNAT1P51948 309 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 RAB11FIP3O75154 756 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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PTPRD-214ENST00000540109 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 MCM3P25205 808 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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PTPRD-214ENST00000540109 UVSSAQ2YD98 709 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 DRC1Q96MC2 740 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 CPDO75976 1380 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 POTEB2H3BUK9 544 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 GCP02774 474 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 FLIIQ13045 1269 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 SPG7Q9UQ90 795 aa7.15□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 A6NNZ2 444 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 CEP85Q6P2H3 762 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 OFD1O75665 1012 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 ALDH1L1O75891 902 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 FBXW7Q969H0 707 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.13□□□□□ -1.27
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