RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530484.1

USP17L3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L3, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3-201ENST00000530484 TJP1Q07157 1748 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 GCKRQ14397 625 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 MYD88Q99836 296 aa14.6□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.59□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP17L3-201ENST00000530484 COL15A1P39059 1388 aa14.58□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SRGAP3O43295 1099 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.57□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 RAB11FIP3O75154 756 aa14.56□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.56□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.56□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 APBB1O00213 710 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 KAZALD1Q96I82 304 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SUCLG2Q96I99 432 aa14.55□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 RREB1Q92766 1687 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 ATRNO75882 1429 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 AFF2P51816 1311 aa14.54□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 TTC22Q5TAA0 569 aa14.53□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.53□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 CASP7P55210 303 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP17L3-201ENST00000530484 PALLDQ8WX93 1383 aa14.52□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 A0A087WZG4 1122 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 H7C1W4 665 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 SEC24BO95487 1268 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 NHSQ6T4R5 1651 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 PDE1AP54750 535 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 SIK1P57059 783 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 TCIRG1Q13488 830 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.51□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 A0A0G2JS52 829 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 KCNQ2O43526 872 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 MYT1Q01538 1121 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 STAP2Q9UGK3 403 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 AOX1Q06278 1338 aa14.5□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 MX1P20591 662 aa14.49□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ATP6V1AP38606 617 aa14.49□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.49□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 NUP98P52948 1817 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 CDC45O75419 566 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 BTAF1O14981 1849 aa14.48□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 SBF2Q86WG5 1849 aa14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 ITPK1Q13572 414 aa14.47□□□□□ -0.09
USP17L3-201ENST00000530484 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms