RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
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ACER3-204ENST00000525861 GCKRQ14397 625 aa28.82■■■□□ 2.2
ACER3-204ENST00000525861 SRGAP3O43295 1099 aa28.82■■■□□ 2.2
ACER3-204ENST00000525861 STARD3NLO95772 234 aa28.81■■■□□ 2.2
ACER3-204ENST00000525861 HSPA1LP34931 641 aa28.81■■■□□ 2.2
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ACER3-204ENST00000525861 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.74■■■□□ 2.19
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ACER3-204ENST00000525861 A0A087WZG4 1122 aa28.7■■■□□ 2.18
ACER3-204ENST00000525861 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.7■■■□□ 2.18
ACER3-204ENST00000525861 MSH5O43196 834 aa28.69■■■□□ 2.18
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ACER3-204ENST00000525861 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.68■■■□□ 2.18
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ACER3-204ENST00000525861 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.68■■■□□ 2.18
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ACER3-204ENST00000525861 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.65■■■□□ 2.18
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ACER3-204ENST00000525861 SIK1P57059 783 aa28.65■■■□□ 2.18
ACER3-204ENST00000525861 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
ACER3-204ENST00000525861 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.65■■■□□ 2.18
ACER3-204ENST00000525861 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.64■■■□□ 2.18
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ACER3-204ENST00000525861 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
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ACER3-204ENST00000525861 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
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ACER3-204ENST00000525861 CDC45O75419 566 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 STAP2Q9UGK3 403 aa28.63■■■□□ 2.17
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ACER3-204ENST00000525861 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.62■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
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ACER3-204ENST00000525861 AOX1Q06278 1338 aa28.61■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 SDSP20132 328 aa28.6■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 RREB1Q92766 1687 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 ARXQ96QS3 562 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.58■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ACER3-204ENST00000525861 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 ITPK1Q13572 414 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.57■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.56■■■□□ 2.16
ACER3-204ENST00000525861 COPRSQ9NQ92 184 aa28.56■■■□□ 2.16
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