RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493552.1

CTBP2-210, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-210	ENST00000493552	NPR1	P16066	1061 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CREBZF	Q9NS37	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	SBF1	O95248	1867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	RGL2	O15211	777 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NEFM	P07197	916 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	MCM10	Q7L590	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NBPF26	B4DH59	902 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	POTEI	P0CG38	1075 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	POTEJ	P0CG39	1038 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	EPHX2	P34913	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	HLF	Q16534	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	GPC2	Q8N158	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NBPF15	Q8N660	670 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	FZD9	O00144	591 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	VEGFB	P49765	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	PSMD1	Q99460	953 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	FOXN1	O15353	648 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	MYL6B	P14649	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTBP2-210	ENST00000493552	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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