RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.49■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.49■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 CHMLP26374 656 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 NBPF26B4DH59 902 aa20.47■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 RABEP1Q15276 862 aa20.47■□□□□ 0.87
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TOM1-216ENST00000492723 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.47■□□□□ 0.87
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TOM1-216ENST00000492723 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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TOM1-216ENST00000492723 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.44■□□□□ 0.86
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TOM1-216ENST00000492723 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.42■□□□□ 0.86
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TOM1-216ENST00000492723 CNTROBQ8N137 903 aa20.41■□□□□ 0.86
TOM1-216ENST00000492723 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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TOM1-216ENST00000492723 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.41■□□□□ 0.86
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TOM1-216ENST00000492723 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.4■□□□□ 0.86
TOM1-216ENST00000492723 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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TOM1-216ENST00000492723 DISP2A7MBM2 1401 aa20.38■□□□□ 0.85
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TOM1-216ENST00000492723 ST18O60284 1047 aa20.38■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 IL25Q9H293 177 aa20.38■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 CASP7P55210 303 aa20.37■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 ATG3Q9NT62 314 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 COL15A1P39059 1388 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 ADAMTS2O95450 1211 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 COPRSQ9NQ92 184 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 EXOC5O00471 708 aa20.35■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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TOM1-216ENST00000492723 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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TOM1-216ENST00000492723 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 SGSM2O43147 1006 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 GSE1Q14687 1217 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-216ENST00000492723 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.33■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 NEK4P51957 841 aa20.32■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 ANAPC15P60006 121 aa20.32■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.32■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 ITGB4P16144 1822 aa20.32■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 STARD3NLO95772 234 aa20.32■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 MCM4P33991 863 aa20.32■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 FOXO4P98177 505 aa20.31■□□□□ 0.84
TOM1-216ENST00000492723 EVI5LQ96CN4 794 aa20.31■□□□□ 0.84
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