RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 USP35Q9P2H5 1018 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 MYD88Q99836 296 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 KIF2CQ99661 725 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 PIGBQ92521 554 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 BCL9O00512 1426 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 TJP1Q07157 1748 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 AK9Q5TCS8 1911 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 TOM1O60784 492 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 SLIT2O94813 1529 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 CASC1Q6TDU7 716 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 SNX21Q969T3 373 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 BCL11AQ9H165 835 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 A1BGP04217 495 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 CASP7P55210 303 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 ATG3Q9NT62 314 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 USP26Q9BXU7 913 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 EXOC5O00471 708 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-211ENST00000492185 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 ERC2O15083 957 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTS2O95450 1211 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 H7C1W4 665 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 REC8O95072 547 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 CHMLP26374 656 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 COPRSQ9NQ92 184 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 A0A087WZG4 1122 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 SASH1O94885 1247 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-211ENST00000492185 BARGINQ6ZT62 677 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 STARD3NLO95772 234 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.58e-8■■■□□ 18.4
NELFE-211ENST00000492185 NBR1Q14596 966 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 HSCBQ8IWL3 235 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 PIP4K2BP78356 416 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 FOXO4P98177 505 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 RABEP1Q15276 862 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 DDB1Q16531 1140 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 RREB1Q92766 1687 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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NELFE-211ENST00000492185 RILPL2Q969X0 211 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-211ENST00000492185 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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NELFE-211ENST00000492185 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 GPATCH3Q96I76 525 aa24.39■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 AACSQ86V21 672 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NELFE-211ENST00000492185 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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