RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
USP20-204ENST00000472108 MYD88Q99836 296 aa20.4■□□□□ 0.86
USP20-204ENST00000472108 LNPKQ9C0E8 428 aa20.4■□□□□ 0.86
USP20-204ENST00000472108 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.4■□□□□ 0.86
USP20-204ENST00000472108 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
USP20-204ENST00000472108 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.39■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 GRM8O00222 908 aa20.39■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 FAM161AQ3B820 660 aa20.39■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.39■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 GCKRQ14397 625 aa20.38■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 KCNQ2O43526 872 aa20.37■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 SSH3Q8TE77 659 aa20.37■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 POLA2Q14181 598 aa20.36■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.36■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.35■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 MTX1Q13505 466 aa20.35■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 C8orf34Q49A92 452 aa20.35■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.34■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 SIK1P57059 783 aa20.34■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 PALLDQ8WX93 1383 aa20.34■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 ATP6V1AP38606 617 aa20.33■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 TJP1Q07157 1748 aa20.33■□□□□ 0.85
USP20-204ENST00000472108 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 SRGAP3O43295 1099 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 SUCLG2Q96I99 432 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 KAZALD1Q96I82 304 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.31■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.31■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.3■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 COL15A1P39059 1388 aa20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 A0A087WZG4 1122 aa20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 APBB1O00213 710 aa20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 TCIRG1Q13488 830 aa20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 ITPK1Q13572 414 aa20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 RAB11FIP3O75154 756 aa20.28■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.28■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.28■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.28■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.28■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 H7C1W4 665 aa20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 CASP7P55210 303 aa20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 FAM182BQ5T319 152 aa20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP20-204ENST00000472108 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.26■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.26■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.26■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 ARXQ96QS3 562 aa20.26■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.25■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.25■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 NHSQ6T4R5 1651 aa20.25■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.24■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.24■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 RREB1Q92766 1687 aa20.23■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 HLFQ16534 295 aa20.23■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.23■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.22■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 BCL11AQ9H165 835 aa20.22■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 BTAF1O14981 1849 aa20.22■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.21■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.21■□□□□ 0.83
USP20-204ENST00000472108 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 FOXO4P98177 505 aa20.2■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.2■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 SBF2Q86WG5 1849 aa20.2■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.19■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP20-204ENST00000472108 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms