RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	ST5	P78524	1137 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	FOXN1	O15353	648 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	NEFM	P07197	916 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	POTEC	B2RU33	542 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	TEF	Q10587	303 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	STYK1	Q6J9G0	422 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	SLX4	Q8IY92	1834 aa		13.27	□□□□□ -0.28
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC34A2	O95436	690 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	VEGFB	P49765	207 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	LBX1	P52954	281 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ANP32C	O43423	234 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	SRGN	P10124	158 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	EPHX2	P34913	555 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ECE1	P42892	770 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	NPR1	P16066	1061 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	MCM10	Q7L590	875 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNQ3	O43525	872 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	GPC2	Q8N158	579 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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