RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, human

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRA-208	ENST00000455631	LDHD	Q86WU2	507 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	MASTL	Q96GX5	879 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTPRA-208	ENST00000455631	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	A1BG	P04217	495 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	PASK	Q96RG2	1323 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	AIDA	Q96BJ3	306 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC93	Q567U6	631 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
PTPRA-208	ENST00000455631	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	VEGFB	P49765	207 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	KCNQ3	O43525	872 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	31.27	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	HACL1	Q9UJ83	578 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PTPRA-208	ENST00000455631	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	NPR1	P16066	1061 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	USP16	Q9Y5T5	823 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	EPHX2	P34913	555 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	LBX1	P52954	281 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	OLFM4	Q6UX06	510 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	WBP1L	Q9NX94	342 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PTPRA-208	ENST00000455631	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	31.19	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM177B	A6PVY3	158 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	CNTROB	Q8N137	903 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	RASSF10	A6NK89	507 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	PRKAR2B	P31323	418 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	FZD9	O00144	591 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PTPRA-208	ENST00000455631	GPC2	Q8N158	579 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	ALDH1B1	P30837	517 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	ABHD8	Q96I13	439 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	NBPF26	B4DH59	902 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	NBPF15	Q8N660	670 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	JDP2	Q8WYK2	163 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	RGL2	O15211	777 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	MCM10	Q7L590	875 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	SNED1	Q8TER0	1413 aa		31.07	■■■□□ 2.57
PTPRA-208	ENST00000455631	LTBP1	Q14766	1721 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	HLF	Q16534	295 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	PSMD1	Q99460	953 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	31.07	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	COL4A5	P29400	1685 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	ABCC12	Q96J65	1359 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	CFAP53	Q96M91	514 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	GRM1	Q13255	1194 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PTPRA-208	ENST00000455631	DCTN1	Q14203	1278 aa		31.02	■■■□□ 2.56

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