RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438196.2

RPS29P6-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P6, Length 145 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P6-201ENST00000438196 PHF8Q9UPP1 1060 aa3.52□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 TAF6LQ9Y6J9 622 aa3.52□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 LAMB4A4D0S4 1761 aa3.52□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 KIF1AQ12756 1690 aa3.52□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 MED23Q9ULK4 1368 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 TTC41PQ6P2S7 1318 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ST18O60284 1047 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ADD1P35611 737 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ESCO1Q5FWF5 840 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 EPHA10Q5JZY3 1008 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 VPS53Q5VIR6 699 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 MCTP1Q6DN14 999 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 USP48Q86UV5 1035 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ZSCAN30Q86W11 494 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 TICAM2Q86XR7 235 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NUTM1Q86Y26 1132 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 USHBP1Q8N6Y0 703 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ABTB2Q8N961 1025 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 LINS1Q8NG48 757 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ORAI2Q96SN7 254 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 AGXT2Q9BYV1 514 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 MTMR6Q9Y217 621 aa3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 MYH7P12883 1935 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SPEF2Q9C093 1822 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 TAF5LO75529 589 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SURF6O75683 361 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ANXA1P04083 346 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SYT1P21579 422 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 MCM5P33992 734 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 AK2P54819 239 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 FOXO4P98177 505 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 PSME1Q06323 249 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ME3Q16798 604 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 UVSSAQ2YD98 709 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 AMOTQ4VCS5 1084 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SLC4A10Q6U841 1118 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 FBXL16Q8N461 479 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 KCNH5Q8NCM2 988 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SUCLG2Q96I99 432 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 STK31Q9BXU1 1019 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 COPRSQ9NQ92 184 aa3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 KCPQ6ZWJ8 1503 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ITGB4P16144 1822 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 C1orf167Q5SNV9 1468 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SYCE3A1L190 88 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 BTBD11A6QL63 1104 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NEURL1BA8MQ27 555 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NBPF26B4DH59 902 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 H7C1W4 665 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 APBB1O00213 710 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 GRM8O00222 908 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 FOXP2O15409 715 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 CYP27B1O15528 508 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SRGAP3O43295 1099 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 CPA1P15085 419 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ATP5JP18859 108 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 EVCP57679 992 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 GCKRQ14397 625 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NBPF14Q5TI25 921 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 LMOD2Q6P5Q4 547 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NBPF15Q8N660 670 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 NECTIN2Q92692 538 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P6-201ENST00000438196 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms