RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431013.1

KRTAP9-11P-201, Transcript of keratin associated protein 9-11, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene KRTAP9-11P, Length 525 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 NEFMP07197 916 aa10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CABP4P57796 275 aa10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CCDC27Q2M243 656 aa10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.65□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 RASSF10A6NK89 507 aa10.65□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.65□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 BICDL1Q6ZP65 573 aa10.65□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.65□□□□□ -0.7
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 APAF1O14727 1248 aa10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 IL17REQ8NFR9 667 aa10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 RIPK4P57078 832 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CNTROBQ8N137 903 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 LGR6Q9HBX8 967 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZNF521Q96K83 1311 aa10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 EPHX2P34913 555 aa10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CAPNS2Q96L46 248 aa10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 NARFQ9UHQ1 456 aa10.61□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 AOC2O75106 756 aa10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 SOX10P56693 466 aa10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 DGKZQ13574 1117 aa10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 HACL1Q9UJ83 578 aa10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 IL16Q14005 1332 aa10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZNF853P0CG23 659 aa10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 WDR63Q8IWG1 891 aa10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 WWC1Q8IX03 1113 aa10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.58□□□□□ -0.71
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 COL15A1P39059 1388 aa10.58□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 MCM10Q7L590 875 aa10.58□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CHL1O00533 1208 aa10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 PDE6BP35913 854 aa10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ECE1P42892 770 aa10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 SLC39A6Q13433 755 aa10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 DCTN1Q14203 1278 aa10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TJP1Q07157 1748 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TRAF5O00463 557 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TEFQ10587 303 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 NEUROD2Q15784 382 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 OLFM4Q6UX06 510 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 BRIP1Q9BX63 1249 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 NRXN2Q9P2S2 1712 aa10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CST9Q5W186 159 aa10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 ZNF790Q6PG37 636 aa10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 CNKSR1Q969H4 720 aa10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 IFT57Q9NWB7 429 aa10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 NPHP1O15259 732 aa10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 GNAI1P63096 354 aa10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
KRTAP9-11P-201ENST00000431013 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms