RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.08■■■□□ 2.41
SERF1B-201ENST00000380750 RAB11FIP3O75154 756 aa30.08■■■□□ 2.41
SERF1B-201ENST00000380750 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SERF1B-201ENST00000380750 C8orf37Q96NL8 207 aa30.08■■■□□ 2.41
SERF1B-201ENST00000380750 SUCLG2Q96I99 432 aa30.07■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 NGLY1Q96IV0 654 aa30.07■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.07■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 DNAJC10Q8IXB1 793 aa30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 OSBPL3Q9H4L5 887 aa30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 KAZALD1Q96I82 304 aa30.06■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.05■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.05■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 VPS72Q15906 364 aa30.04■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 TBC1D32Q96NH3 1257 aa30.04■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 SALL3Q9BXA9 1300 aa30.04■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 STARD3NLO95772 234 aa30.04■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa30.04■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 PDE1AP54750 535 aa30.02■■■□□ 2.4
SERF1B-201ENST00000380750 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.01■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa30■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 KIF1BPQ96EK5 621 aa30■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 SLC4A9Q96Q91 983 aa30■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 COL15A1P39059 1388 aa30■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 CDC45O75419 566 aa29.99■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.99■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 RHPN1Q8TCX5 695 aa29.99■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 MX1P20591 662 aa29.97■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.97■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 STAP2Q9UGK3 403 aa29.97■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 A0A087WZG4 1122 aa29.96■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.96■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 SDSP20132 328 aa29.95■■■□□ 2.39
SERF1B-201ENST00000380750 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.95■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.95■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.95■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.95■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 CASP7P55210 303 aa29.94■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.93■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 AOX1Q06278 1338 aa29.93■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 H7C1W4 665 aa29.93■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.93■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.93■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 USP21Q9UK80 565 aa29.93■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.92■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 TJP1Q07157 1748 aa29.91■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.9■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 A0A0G2JS52 829 aa29.89■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 HSPA1LP34931 641 aa29.89■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 TCIRG1Q13488 830 aa29.89■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.89■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.89■■■□□ 2.38
SERF1B-201ENST00000380750 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.88■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.87■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.87■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 CASC1Q6TDU7 716 aa29.86■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.84■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 SIK1P57059 783 aa29.84■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 COPRSQ9NQ92 184 aa29.84■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 FOXO4P98177 505 aa29.83■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.83■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 KCNQ2O43526 872 aa29.82■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 SASH1O94885 1247 aa29.82■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 PALLDQ8WX93 1383 aa29.82■■■□□ 2.37
SERF1B-201ENST00000380750 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 ATP6V1AP38606 617 aa29.82■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.81■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 PI4K2BQ8TCG2 481 aa29.81■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms