RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.83■■□□□ 1.57
PUS1-201ENST00000322060 MASTLQ96GX5 879 aa24.82■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 POTECB2RU33 542 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 NPHP1O15259 732 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 ERFEQ4G0M1 354 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 SOGA3Q5TF21 947 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 MCM10Q7L590 875 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.81■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.79■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.79■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.79■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 BCORQ6W2J9 1755 aa24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PUS1-201ENST00000322060 NBPF26B4DH59 902 aa24.76■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.76■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 NBPF15Q8N660 670 aa24.76■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.76■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 DCTN1Q14203 1278 aa24.75■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 SLX4Q8IY92 1834 aa24.75■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 NPR1P16066 1061 aa24.74■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.72■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 CCDC93Q567U6 631 aa24.71■■□□□ 1.55
PUS1-201ENST00000322060 NEFMP07197 916 aa24.7■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 CHADLQ6NUI6 762 aa24.68■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 ALDH1B1P30837 517 aa24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 HLFQ16534 295 aa24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.67■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.66■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 NYXQ9GZU5 481 aa24.64■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PUS1-201ENST00000322060 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 CRY2Q49AN0 593 aa24.63■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 CREBZFQ9NS37 354 aa24.63■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 CACNA1SQ13698 1873 aa24.62■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 NFE2L2Q16236 605 aa24.62■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.61■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 FAM177BA6PVY3 158 aa24.61■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 LDHDQ86WU2 507 aa24.61■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.6■■□□□ 1.53
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PUS1-201ENST00000322060 POTEJP0CG39 1038 aa24.6■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.59■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 PCNTO95613 3336 aa24.59■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 SCN4AP35499 1836 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 FZD9O00144 591 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 OLFM4Q6UX06 510 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 NGEFQ8N5V2 710 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 PSMD1Q99460 953 aa24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PUS1-201ENST00000322060 ERBB4Q15303 1308 aa24.58■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.57■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.57■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 SYNE4Q8N205 404 aa24.57■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.57■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 PASKQ96RG2 1323 aa24.57■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 SNED1Q8TER0 1413 aa24.56■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.56■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.55■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.55■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 HACL1Q9UJ83 578 aa24.55■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 ABCC12Q96J65 1359 aa24.54■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.54■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 NUP98P52948 1817 aa24.54■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 MYL6BP14649 208 aa24.53■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 SUSD4Q5VX71 490 aa24.53■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PUS1-201ENST00000322060 TNS4Q8IZW8 715 aa24.53■■□□□ 1.52
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