RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 PANK2Q9BZ23 570 aa23.37■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.37■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 UTYO14607 1347 aa23.36■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 ABCC6O95255 1503 aa23.36■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 HSPA4P34932 840 aa23.36■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 KAZALD1Q96I82 304 aa23.36■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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USP21-201ENST00000289865 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.35■■□□□ 1.33
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USP21-201ENST00000289865 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 RAD50Q92878 1312 aa23.35■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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USP21-201ENST00000289865 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 CYP27B1O15528 508 aa23.33■■□□□ 1.33
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USP21-201ENST00000289865 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.33■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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USP21-201ENST00000289865 DCAF5Q96JK2 942 aa23.33■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.33■■□□□ 1.33
USP21-201ENST00000289865 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.33■■□□□ 1.33
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USP21-201ENST00000289865 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.33■■□□□ 1.32
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USP21-201ENST00000289865 AACSQ86V21 672 aa23.32■■□□□ 1.32
USP21-201ENST00000289865 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.32■■□□□ 1.32
USP21-201ENST00000289865 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.31■■□□□ 1.32
USP21-201ENST00000289865 MYD88Q99836 296 aa23.31■■□□□ 1.32
USP21-201ENST00000289865 USP16Q9Y5T5 823 aa23.31■■□□□ 1.32
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USP21-201ENST00000289865 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
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USP21-201ENST00000289865 SASH1O94885 1247 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP21-201ENST00000289865 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.29■■□□□ 1.32
USP21-201ENST00000289865 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP21-201ENST00000289865 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP21-201ENST00000289865 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.28■■□□□ 1.32
USP21-201ENST00000289865 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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USP21-201ENST00000289865 EVI5LQ96CN4 794 aa23.25■■□□□ 1.31
USP21-201ENST00000289865 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.25■■□□□ 1.31
USP21-201ENST00000289865 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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USP21-201ENST00000289865 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.2■■□□□ 1.3
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USP21-201ENST00000289865 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.19■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.19■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.19■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.18■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 CPA1P15085 419 aa23.18■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.18■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 FAM227BQ96M60 508 aa23.18■■□□□ 1.3
USP21-201ENST00000289865 HIP1O00291 1037 aa23.17■■□□□ 1.3
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