RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 ATF3P18847 181 aa19■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 NLRP2Q9NX02 1062 aa19■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 TATP17735 454 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 ZNF790Q6PG37 636 aa19■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 SPG7Q9UQ90 795 aa19■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 GRM8O00222 908 aa18.99■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.99■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 UTYO14607 1347 aa18.99■□□□□ 0.63
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POP4-201ENST00000221770 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.98■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.98■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 RAD50Q92878 1312 aa18.98■□□□□ 0.63
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POP4-201ENST00000221770 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
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POP4-201ENST00000221770 SLC39A6Q13433 755 aa18.96■□□□□ 0.63
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POP4-201ENST00000221770 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.96■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 TPM2P07951 284 aa18.95■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.95■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 ZNF445P59923 1031 aa18.95■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.95■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.95■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.94■□□□□ 0.62
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POP4-201ENST00000221770 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.91■□□□□ 0.62
POP4-201ENST00000221770 DCAF5Q96JK2 942 aa18.91■□□□□ 0.62
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POP4-201ENST00000221770 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
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POP4-201ENST00000221770 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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POP4-201ENST00000221770 CHRNA2Q15822 529 aa18.88■□□□□ 0.61
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POP4-201ENST00000221770 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
POP4-201ENST00000221770 USP16Q9Y5T5 823 aa18.88■□□□□ 0.61
POP4-201ENST00000221770 CYP27B1O15528 508 aa18.87■□□□□ 0.61
POP4-201ENST00000221770 PTH1RQ03431 593 aa18.87■□□□□ 0.61
POP4-201ENST00000221770 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.87■□□□□ 0.61
POP4-201ENST00000221770 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.86■□□□□ 0.61
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