RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 TAF3Q5VWG9 929 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 AP5Z1O43299 807 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 F13A1P00488 732 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 ORAI2Q96SN7 254 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 STK31Q9BXU1 1019 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 AOX1Q06278 1338 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA11-201ENST00000006015 FIBPO43427 364 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 OGFRQ9NZT2 677 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 MAP3K5Q99683 1374 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 FLIIQ13045 1269 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 SYT1P21579 422 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 IP6K1Q92551 441 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC192P0DO97 292 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 SPC24Q8NBT2 197 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 LGR6Q9HBX8 967 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 TTC14Q96N46 770 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 RAD50Q92878 1312 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 SMTNL1A8MU46 457 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXA11-201ENST00000006015 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 GNAI3P08754 354 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 AK2P54819 239 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 PTGS1P23219 599 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 KCNQ3O43525 872 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 IL25Q9H293 177 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 ATP8B2P98198 1209 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 LTN1O94822 1766 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 FGD1P98174 961 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 RUFY3Q7L099 469 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 LRRC37A3O60309 1634 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 GCP02774 474 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 MTMR6Q9Y217 621 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 NFAT5O94916 1531 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 SGSM2O43147 1006 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXA11-201ENST00000006015 MAP3K11Q16584 847 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 ANXA1P04083 346 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 GJB2P29033 226 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 USP54Q70EL1 1684 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 IGSF3O75054 1194 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 TNNT1P13805 278 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 TYRO3Q06418 890 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 USP44Q9H0E7 712 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 RASEFQ8IZ41 740 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 HYPKQ9NX55 129 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 ELP1O95163 1332 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 LARGE1O95461 756 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 LUZP1Q86V48 1076 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA11-201ENST00000006015 DRC7Q8IY82 874 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms