RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629899.1

HPVC1-201, humanhuman

BASIC

Gene HPVC1, Length 1,198 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPVC1-201ENST00000629899 COPB2P35606 906 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 GSTO1P78417 241 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 ITPK1Q13572 414 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 EMC2Q15006 297 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 TRADDQ15628 312 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 SFRP1Q8N474 314 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 SNX21Q969T3 373 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 CAPNS2Q96L46 248 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 NARFQ9UHQ1 456 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.6□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 MELTFP08582 738 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 CCDC159P0C7I6 412 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 ZNF18P17022 549 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 KRTAP10-5P60370 271 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 HERV-K104P63124 156 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 HAGHQ16775 308 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 LEMD1Q68G75 181 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 RHBDD2Q6NTF9 364 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 REG3GQ6UW15 175 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 GPR142Q7Z601 462 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 OR4F5Q8NH21 305 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 RDH11Q8TC12 318 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 GPR137Q96N19 417 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 Q9HAA7 133 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 PIGVQ9NUD9 493 aa4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
HPVC1-201ENST00000629899 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 ATP6V1G1O75348 118 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 BAG2O95816 211 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 FCGR3AP08637 254 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 AREGP15514 252 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 CALML3P27482 149 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 PPP2R1BP30154 601 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 CCZ1BP86790 482 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 EPC2Q52LR7 807 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 EIPR1Q53HC9 387 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 NHLRC3Q5JS37 347 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 SNX32Q86XE0 403 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 RAB39BQ96DA2 213 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 PRAM1Q96QH2 718 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 C19orf43Q9BQ61 176 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 CYP39A1Q9NYL5 469 aa4.58□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 E9PAM4 449 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 E2F3O00716 465 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 OLFM2O95897 454 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 APRTP07741 180 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 HLA-DPA1P20036 260 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 NDST1P52848 882 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 UBXN1Q04323 297 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 UNC50Q53HI1 259 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 Q6ZR54 194 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 NTNG2Q96CW9 530 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 AMBNQ9NP70 447 aa4.57□□□□□ -1.68
HPVC1-201ENST00000629899 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms