RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 OTULINQ96BN8 352 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 F2RL3Q96RI0 385 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 OR2AG1Q9H205 316 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SERTM1A2A2V5 107 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GLOD5A6NK44 160 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 LEFTY2O00292 366 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 AKR7A2O43488 359 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MPZL2O60487 215 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RHAGQ02094 409 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GINS1Q14691 196 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 FRMD6Q96NE9 622 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GPA33Q99795 319 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NLKQ9UBE8 527 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 A0A1B0GVC2 190 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 FEZF1A0PJY2 475 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HYKKA2RU49 373 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HMX3A6NHT5 357 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 A6NIN4 97 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SLC28A2O43868 658 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TSC22D2O75157 780 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 C1orf105O95561 183 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HSD3B1P14060 373 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HSD3B2P26439 372 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SOX18P35713 384 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SNAPC1Q16533 368 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SAXO2Q658L1 398 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TM9SF4Q92544 642 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PLA2G10O15496 165 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 FRS3O43559 492 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 KCNC3Q14003 757 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 IQCHQ86VS3 1027 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TMED9Q9BVK6 235 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PPM1DO15297 605 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 B4GALT2O60909 372 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 OR12D1P0DN82 309 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 C21orf58P58505 322 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 GPLD1P80108 840 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TRIM69Q86WT6 500 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 GLYATL1Q969I3 302 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SPG21Q9NZD8 308 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SCO2O43819 266 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 HPGDSO60760 199 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 HTR2BP41595 481 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TAP2Q03519 686 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ART5Q96L15 291 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 RNF121Q9H920 327 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CASKO14936 926 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ADAP00813 363 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 EPHX1P07099 455 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 CTSLP07711 333 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ELFN1P0C7U0 828 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 ILKQ13418 452 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TATDN3Q17R31 274 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM215Q68D42 235 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 PLET1Q6UQ28 207 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP4-211ENST00000622020 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms