RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197		G3V3Y1	287 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TP53I11	O14683	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	BCKDK	O14874	412 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMPRSS11D	O60235	418 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUPT7L	O94864	414 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GBA	P04062	536 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NT5E	P21589	574 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HMOX2	P30519	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	RASA2	Q15283	850 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	LIX1	Q8N485	282 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	RND1	Q92730	232 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	BRF2	Q9HAW0	419 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNIH4	Q9P003	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	C1orf226	A1L170	272 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197		A8MT66	165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	RIPK2	O43353	540 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRCP	O75575	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP6AP2	O75787	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	WISP2	O76076	250 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGKV3-11	P04433	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GSTA1	P08263	222 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNASE1L1	P49184	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAN2A2	P49641	1150 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	XK	P51811	444 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDH13	P55290	713 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLC	Q05315	142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRAF3	Q13114	568 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	METTL4	Q8N3J2	472 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC126	Q96EE4	140 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHF12	Q96QT6	1004 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMC6	Q96SB8	1091 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SVIL	O95425	2214 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ULK1	O75385	1050 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCL3	P10147	92 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSD3B1	P14060	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPM	P14384	443 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSPAN8	P19075	237 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSD3B2	P26439	372 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ECHS1	P30084	290 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GCK	P35557	465 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PIGA	P37287	484 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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