RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 OR12D2P58182 307 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ACTBP60709 375 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RAB8AP61006 207 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ACTG1P63261 375 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 POU4F2Q12837 409 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DYRK1AQ13627 763 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SPRED1Q7Z699 444 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NEK7Q8TDX7 302 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RADILQ96JH8 1075 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC38A3Q99624 504 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NIT2Q9NQR4 276 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GPR83Q9NYM4 423 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LCHNA4D1U4 455 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR1F1O43749 312 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 VNN1O95497 513 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DDCP20711 480 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 AGXTP21549 392 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HLA-DMAP28067 261 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SERPINF1P36955 418 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR4D2P58180 307 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ARHGAP1Q07960 439 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GINS1Q14691 196 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 VITQ6UXI7 678 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SYT14Q8NB59 555 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ST8SIA4Q92187 359 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TFAP2BQ92481 460 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NKD1Q969G9 470 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC32A1Q9H598 525 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FBRSQ9HAH7 460 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RIPK3Q9Y572 518 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 A0A0U1RQF3 1178 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SHOXO15266 292 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RDH16O75452 317 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TFPIP10646 304 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DLSTP36957 453 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ETV6P41212 452 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NPY5RQ15761 445 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C14orf80Q86SX3 495 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OCEL1Q9H607 264 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OLAHQ9NV23 265 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MED31Q9Y3C7 131 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 H7C417 338 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TPST2O60704 377 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GJB1P08034 283 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 HTR1AP08908 422 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 NAT2P11245 290 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ADH5P11766 374 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 JUPP14923 745 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 KDELR2P33947 212 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 INCA1Q0VD86 236 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GPR68Q15743 365 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 RNF212Q495C1 297 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 GKN2Q86XP6 184 aa6.59□□□□□ -1.36
CLCN3-211ENST00000613795 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
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