RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 SGCEO43556 437 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP2K4P45985 399 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 NCDNQ9UBB6 729 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 A6NHS1 94 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CHRNA6Q15825 494 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MYLK3Q32MK0 819 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MAPK15Q8TD08 544 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MR1Q95460 341 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR8D2Q9GZM6 311 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 HIPK2Q9H2X6 1198 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 FOLH1BQ9HBA9 442 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNJ16Q9NPI9 418 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJB4Q9UDY4 337 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 RETP07949 1114 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNIP4Q6PIL6 250 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 IL17RCQ8NAC3 791 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2A12Q8NGT7 310 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 C10orf82Q8WW14 230 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 NR4A3Q92570 626 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 DPEP3Q9H4B8 488 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF286AQ9HBT8 521 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6C65A6NJZ3 312 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 POU3F4P49335 361 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTC1P68032 377 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTA1P68133 377 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC116Q8IYX3 515 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MYLIPQ8WY64 445 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX30O94993 753 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKCZQ05513 592 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CA5BQ9Y2D0 317 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 H7C1Q1 480 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SYN3O14994 580 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TBX10O75333 385 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ADH5P11766 374 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 RSPRY1Q96DX4 576 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SNX27Q96L92 541 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CYB5BO43169 146 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 STT3AP46977 705 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2AP1Q8NGE2 309 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR13C4Q8NGS5 318 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 LMF1Q96S06 567 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OXSMQ9NWU1 459 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SCN3AQ9NY46 2000 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 E9PI62 339 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 UCHL1P09936 223 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PNMTP11086 282 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PBX2P40425 430 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CYCSP99999 105 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MC2RQ01718 297 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CTC1Q2NKJ3 1217 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CST9LP1Q5W188 147 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC27A4Q6P1M0 643 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF610Q8N9Z0 462 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM4Q9UKN5 801 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 IRS2Q9Y4H2 1338 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ADORA3P0DMS8 318 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4K14Q8NGD5 310 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR51Q1Q8NH59 317 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PAQR8Q8TEZ7 354 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALS13Q9UHV8 139 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 IQGAP1P46940 1657 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 OR9K2Q8NGE7 335 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC5A11Q8WWX8 675 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 HS6ST2Q96MM7 605 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 CILPO75339 1184 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 AMY2AP04746 511 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 BANPQ8N9N5 519 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GALT7Q9UBV7 327 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A087WUU8 490 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 RFPL2O75678 378 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 BPIP17213 487 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 KLBQ86Z14 1044 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 NPAS3Q8IXF0 933 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 DEDD2Q8WXF8 326 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM46BQ96A09 425 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 SNX18Q96RF0 628 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF536O15090 1300 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 JCADQ9P266 1359 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 MADDQ8WXG6 1647 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRJ-207ENST00000613246 LOC730098B7Z3J9 87 aa17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms