RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 SCIMPQ6UWF3 145 aa25■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 IL20RBQ6UXL0 311 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 GALNT12Q8IXK2 581 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 CLEC18CQ8NCF0 446 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 UCN3Q969E3 161 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 FAM111AQ96PZ2 611 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 RASL10BQ96S79 203 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 OSGIN2Q9Y236 505 aa25■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 SLC48A1Q6P1K1 146 aa24.99■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 SLC22A8Q8TCC7 542 aa24.99■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 SSC4DQ8WTU2 575 aa24.99■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 RAB21Q9UL25 225 aa24.99■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 SLC5A6Q9Y289 635 aa24.99■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa24.99■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 UNC5CO95185 931 aa24.98■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 FOXA1P55317 472 aa24.98■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 GAL3ST4Q96RP7 486 aa24.98■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 TRMOQ9BU70 441 aa24.98■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 SERTM1A2A2V5 107 aa24.97■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 OR6C76A6NM76 312 aa24.97■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 ZNF24P17028 368 aa24.97■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 ZNF227Q86WZ6 799 aa24.96■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.96■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 PSD4Q8NDX1 1056 aa24.96■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 CXorf21Q9HAI6 301 aa24.96■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 SLC17A7Q9P2U7 560 aa24.96■■□□□ 1.59
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BRD4-208ENST00000597315 ALDH3A1P30838 453 aa24.95■■□□□ 1.58
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BRD4-208ENST00000597315 PER3P56645 1201 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 PIGGQ5H8A4 983 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 MDGA2Q7Z553 956 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 SULF2Q8IWU5 870 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 CDC26Q8NHZ8 85 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 EBPLQ9BY08 206 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 BRINP2Q9C0B6 783 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 UTS2RQ9UKP6 389 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.95■■□□□ 1.58
BRD4-208ENST00000597315 SVILO95425 2214 aa24.94■■□□□ 1.58
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