RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SPACA6	W5XKT8	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MPDZ	O75970	2070 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422		K7EPI3	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TMPRSS11D	O60235	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	WDR1	O75083	606 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GSTA2	P09210	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RAP1GDS1	P52306	607 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	WNT3	P56703	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	HERVK_113	P63132	956 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ERVK-8	P63133	956 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	KCNJ2	P63252	427 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	IRF9	Q00978	393 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GPR180	Q86V85	440 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PPM1N	Q8N819	430 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	UBE2E3	Q969T4	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	EXO5	Q9H790	373 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422		A0A0A6YYD5	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422		A0A1W2PR48	441 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	HCN1	O60741	890 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZWINT	O95229	277 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FAM153B	P0C7A2	387 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CD1E	P15812	388 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SERPINB1	P30740	379 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TRPC1	P48995	793 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FAM153C	Q494X1	144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	RGMA	Q96B86	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NXNL1	Q96CM4	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	LIME1	Q9H400	295 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	ASB4	Q9Y574	426 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	HMX2	A2RU54	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PROM1	O43490	865 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CTAG2	O75638	210 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	AIFM1	O95831	613 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GBA	P04062	536 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	NR2F6	P10588	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	EPB42	P16452	691 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SSTR4	P31391	388 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	BSG	P35613	385 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	PIK3CB	P42338	1070 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	IST1	P53990	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SLC37A1	P57057	533 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTIF-208	ENST00000590422	CES4A	Q5XG92	561 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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