RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 FAM171BQ6P995 826 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ARL14Q8N4G2 192 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CDC26Q8NHZ8 85 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 MAPK15Q8TD08 544 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 MGARPQ8TDB4 240 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 NCLNQ969V3 563 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CNDP1Q96KN2 507 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ART5Q96L15 291 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 COQ7Q99807 217 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 WNT5BQ9H1J7 359 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 UCK1Q9HA47 277 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 FAIMQ9NVQ4 179 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 DEC1Q9P2X7 70 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CPQQ9Y646 472 aa4.56□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ESPL1Q14674 2120 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC69A6NI79 296 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 K7ENM7 598 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 VILLO15195 856 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 SERPINB7O75635 380 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 SEMA4FO95754 770 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 AGR2O95994 175 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ACADMP11310 421 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 HPGDP15428 266 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ANOS1P23352 680 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CRABP2P29373 138 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 KRT20P35900 424 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 HSPA13P48723 471 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 MAP3K7CLP57077 242 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 GSDMDP57764 484 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ASIC1P78348 528 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 FOXM1Q08050 763 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 GTF2H2Q13888 395 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 BNIPLQ7Z465 357 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ZFAND4Q86XD8 727 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 SCFD1Q8WVM8 642 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 STARD8Q92502 1023 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 AZIN2Q96A70 460 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 LURAP1Q96LR2 239 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CARD9Q9H257 536 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM245Q9H330 911 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 EHD1Q9H4M9 534 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 GDF3Q9NR23 364 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 BARHL2Q9NY43 387 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.55□□□□□ -1.68
ATXN3-218ENST00000553309 PLXNA2O75051 1894 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms