RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 NSA2O95478 260 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CHRNGP07510 517 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 SP1P08047 785 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ALOX12P18054 663 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 DNASE1P24855 282 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ARRB2P32121 409 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 NEK2P51955 445 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 HERC3Q15034 1050 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CHI3L2Q15782 390 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 FAM219BQ5XKK7 198 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PRMT9Q6P2P2 845 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TMEM205Q6UW68 189 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CHSY3Q70JA7 882 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ABHD13Q7L211 337 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PRSS41Q7RTY9 318 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ZNF227Q86WZ6 799 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CDC20BQ86Y33 519 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 OR2L5Q8NG80 312 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 SPATA3Q8NHX4 192 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 FAM57AQ8TBR7 257 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 METTL6Q8TCB7 284 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 GAL3ST3Q96A11 431 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 MS4A6EQ96DS6 147 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CMTM7Q96FZ5 175 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ELOVL6Q9H5J4 265 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CDC14AQ9UNH5 594 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 SNX6Q9UNH7 406 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 SCN3AQ9NY46 2000 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 GABRR3A8MPY1 467 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 H0YIG0 161 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 MANBAO00462 879 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TGFB1P01137 390 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 KRT6AP02538 564 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 KRT6BP04259 564 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ZNF24P17028 368 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 IL1RNP18510 177 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 BGNP21810 368 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 GRK2P25098 689 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 HMOX2P30519 316 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CHRNB4P30926 498 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PTGS2P35354 604 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 KRT6CP48668 564 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 FOXA1P55317 472 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 RPS13P62277 151 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PHEXP78562 749 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 DEFB134Q4QY38 66 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TMEM35AQ53FP2 167 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 DEPDC1Q5TB30 811 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ABHD17CQ6PCB6 329 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PDSS2Q86YH6 399 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 OR9A4Q8NGU2 314 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 F2RL3Q96RI0 385 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 KCNA7Q96RP8 456 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 OR51B5Q9H339 312 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 KCNK13Q9HB14 408 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ANKHQ9HCJ1 492 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 MED4Q9NPJ6 270 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TIMM22Q9Y584 194 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 TMEM114B3SHH9 223 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ERI3O43414 337 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 HS6ST1O60243 411 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ULK1O75385 1050 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 ETHE1O95571 254 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 B3GALT4O96024 378 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PDYNP01213 254 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 HEXAP06865 529 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 FGF4P08620 206 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 UROSP10746 265 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CD46P15529 392 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 AVPR1BP47901 424 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 HTR6P50406 440 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 PLA2G16P53816 162 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 RAB8AP61006 207 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 STX3Q13277 289 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 CUL3Q13618 768 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 SGO1Q5FBB7 561 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-231ENST00000552222 SLC25A25Q6KCM7 469 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms