RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PCTPQ9UKL6 214 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 H7BY64 318 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 THEM6Q8WUY1 208 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 DPH7Q9BTV6 452 aa8.12□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 INHBCP55103 352 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.12□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.12□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM129BQ96TA1 746 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 A8MUI8 341 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ARNTLO00327 626 aa8.12□□□□□ -1.11
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