RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MANBA	O00462	879 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	PLIN3	O60664	434 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CTNS	O60931	367 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SPAG7	O75391	227 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CLDN9	O95484	217 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	AIFM1	O95831	613 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	KLK1	P06870	262 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CT62	P0C5K7	136 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	IMPDH1	P20839	514 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	S1PR1	P21453	382 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	IL10	P22301	178 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CNTF	P26441	200 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CCNG1	P51959	295 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	KCNK10	P57789	538 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MLF1	P58340	268 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	HERVK_113	P63132	956 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	FOLH1	Q04609	750 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MGAT2	Q10469	447 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP8	Q13202	625 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MPP2	Q14168	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	KLC3	Q6P597	504 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TTL	Q8NG68	377 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	RGMA	Q96B86	450 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	APIP	Q96GX9	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	FAR2	Q96K12	515 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	MECR	Q9BV79	373 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	URAD	A6NGE7	173 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	GABRR3	A8MPY1	467 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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