RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 BSNQ9UPA5 3926 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PRG6 482 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 C5orf60A6NFR6 353 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 LINC00587B1AMM8 73 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 CLDN4O14493 209 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 ITGB1BP1O14713 200 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 RHBDL1O75783 438 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TGM6O95932 706 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TNNC2P02585 160 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 ACADMP11310 421 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 CBR1P16152 277 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 PRKCHP24723 683 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 RBL1P28749 1068 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 PTPN7P35236 360 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 RASSF2P50749 326 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 CDH8P55286 799 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 NUP107P57740 925 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 CDK16Q00536 496 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 KCNJ12Q14500 433 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 ZNF234Q14588 700 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TRIM16LQ309B1 348 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 MLIPQ5VWP3 458 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 USP49Q70CQ1 688 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TDRPQ86YL5 185 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 GPD1LQ8N335 351 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 OR2L3Q8NG85 312 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 HTRA1Q92743 480 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 KIAA1191Q96A73 305 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 BIRC7Q96CA5 298 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 LRFN5Q96NI6 719 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 ACCSQ96QU6 501 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TWNKQ96RR1 684 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 BCO1Q9HAY6 547 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 NMUR1Q9HB89 426 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 PLK2Q9NYY3 685 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 FKBP7Q9Y680 259 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 A0A075B6Q4 140 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MED7O43513 233 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DFNA5O60443 496 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MTX2O75431 263 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GPX5O75715 221 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BEST1O76090 585 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ELANEP08246 267 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PRPS1L1P21108 318 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CD27P26842 260 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 STX2P32856 288 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SYKP43405 635 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BMXP51813 675 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CASP6P55212 293 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SELENOVP59797 346 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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LMO3-212ENST00000535535 PDK1Q15118 436 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KYNUQ16719 465 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GID4Q8IVV7 300 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BANPQ8N9N5 519 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CAVIN3Q969G5 261 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MUL1Q969V5 352 aa7.39□□□□□ -1.23
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