RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 CASP2P42575 452 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SSR2P43308 183 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 DCAF7P61962 342 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 IRF8Q02556 426 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SLAMF1Q13291 335 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 RCN2Q14257 317 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 VASNQ6EMK4 673 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CAPN12Q6ZSI9 719 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 LACC1Q8IV20 430 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 LAS2Q8IYD9 372 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PDIK1LQ8N165 341 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SLC35F6Q8N357 371 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 LIX1Q8N485 282 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 FBXO36Q8NEA4 188 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 EXT2Q93063 718 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 NTNG2Q96CW9 530 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TRIB1Q96RU8 372 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CAPS2Q9BXY5 557 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 UGT2B28Q9BY64 529 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 RHOJQ9H4E5 214 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 QPCTLQ9NXS2 382 aa13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CLCA1A8K7I4 914 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 AHRRA9YTQ3 701 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PLPP1O14494 284 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TMPRSS11DO60235 418 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 EEDO75530 441 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 HPNP05981 417 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CT62P0C5K7 136 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PCNAP12004 261 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 BMP7P18075 431 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TNFRSF17Q02223 184 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 DLG1Q12959 904 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 OR4C11Q6IEV9 310 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 MAATS1Q7Z4T9 603 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PRR22Q8IZ63 422 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PDPRQ8NCN5 879 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 OR7G3Q8NG95 312 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 DIO2Q92813 273 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 RILPQ96NA2 401 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CNIH4Q9P003 139 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CAMK2AQ9UQM7 478 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 DOCK7Q96N67 2140 aa13.36□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 A0A1W2PR48 441 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SIAH2O43255 324 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TRAPPC6AO75865 159 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 COX7A2P14406 83 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SERPINB3P29508 390 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 RPL21P46778 160 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 NAGLUP54802 743 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TGM3Q08188 693 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 MORF4L2Q15014 288 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TBCCQ15814 346 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 TMEM35AQ53FP2 167 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 FBXW10Q5XX13 1052 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SULT1C3Q6IMI6 304 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 RNF111Q6ZNA4 994 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SLC15A4Q8N697 577 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SPPL2AQ8TCT8 520 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 SLC44A1Q8WWI5 657 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 ZNF597Q96LX8 424 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 G6PC3Q9BUM1 346 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CD244Q9BZW8 370 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 PHACTR1Q9C0D0 580 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 ROGDIQ9GZN7 287 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 POPDC3Q9HBV1 291 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 CD274Q9NZQ7 290 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 C15orf41Q9Y2V0 281 aa13.35□□□□□ -0.27
BRMS1-208ENST00000530756 ASB4Q9Y574 426 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms