RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526117.5

LMX1B-203, Transcript of LIM homeobox transcription factor 1 beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMX1B, Length 1,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1B-203ENST00000526117 RIT1Q92963 219 aa16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 UCN3Q969E3 161 aa16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 C19orf60Q96EN9 201 aa16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 FIS1Q9Y3D6 152 aa16.07■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 OR5H15A6NDH6 313 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 OR6C76A6NM76 312 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TBX19O60806 448 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TNNI3P19429 210 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MAPK1P28482 360 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TNFSF10P50591 281 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 FUT7Q11130 342 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 HSDL2Q6YN16 418 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MMP21Q8N119 569 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 AMER2Q8N7J2 671 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 Q8NA96 180 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 NUBPLQ8TB37 319 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 KLHL29Q96CT2 875 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ERP27Q96DN0 273 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 EBPLQ9BY08 206 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.06■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 A8MUI8 341 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 FCHO1O14526 889 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 WDPCPO95876 746 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 UQCRHP07919 91 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 IFI6P09912 130 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SDC1P18827 310 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ASMTP46597 345 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ARG2P78540 354 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 OCRLQ01968 901 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MAP4K2Q12851 820 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 INAQ16352 499 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 BEST3Q8N1M1 668 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 AGR3Q8TD06 166 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ZNF675Q8TD23 568 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MGARPQ8TDB4 240 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 CTHRC1Q96CG8 243 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 C3orf30Q96M34 536 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 OR8D2Q9GZM6 311 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ASIC5Q9NY37 505 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MYOTQ9UBF9 498 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 BAHCC1Q9P281 2608 aa16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SLITRK5O94991 958 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 PCSK2P16519 638 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ALDH9A1P49189 494 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 HK2P52789 917 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SLC37A1P57057 533 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 RNF4P78317 190 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TUBA3CQ13748 450 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MPEG1Q2M385 716 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MTERF3Q96E29 417 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 ZNF639Q9UID6 485 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.04■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 A0A1W2PS29 197 aa16.03■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 GABRR3A8MPY1 467 aa16.03■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.03■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 VPS4BO75351 444 aa16.03■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 CLPSP04118 112 aa16.03■□□□□ 0.16
LMX1B-203ENST00000526117 PRPS2P11908 318 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms