RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 LIX1Q8N485 282 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 LUZP4Q9P127 313 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.86□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SDHDO14521 159 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 AKAP10O43572 662 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PRR35P0CG20 571 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 BCKDHAP12694 445 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 GSTM5P46439 218 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 EFNA3P52797 238 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 AQP5P55064 265 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 FOLH1Q04609 750 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 EMX2Q04743 252 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ACAD11Q709F0 780 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 MMP21Q8N119 569 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 NPHS2Q9NP85 383 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.85□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 FGF17O60258 216 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 OR10H2O60403 315 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 GPR75O95800 540 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PRPS2P11908 318 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 DRD2P14416 443 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SDC1P18827 310 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 TACR1P25103 407 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SOX11P35716 441 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ASMTP46597 345 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 UQCRFS1P47985 274 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ERVK-8P63133 956 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SERTAD2Q14140 314 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PCOLCEQ15113 449 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 RPS6KA2Q15349 733 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PSMF1Q92530 271 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 KLHL29Q96CT2 875 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 EGLN2Q96KS0 407 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 DGAT2Q96PD7 388 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 MYNNQ9NPC7 610 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 MAP10Q9P2G4 905 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 HEY2Q9UBP5 337 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.84□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 TGDSO95455 350 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 COX7A2P14406 83 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 XKP51811 444 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 BIKQ13323 160 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SMU1Q2TAY7 513 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 EPGNQ6UW88 154 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 MAVSQ7Z434 540 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 HAS2Q92819 552 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 RILPQ96NA2 401 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 LPAR4Q99677 370 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MEG3-217ENST00000521404 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DYTNA2CJ06 578 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 DYRK3O43781 588 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 CBX6O95503 412 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 G6PDP11413 515 aa14.83□□□□□ -0.04
MEG3-217ENST00000521404 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms