RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, human

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2B-208	ENST00000511807	C4orf51	C9J302	202 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SGK494	L7N484	410 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	GPR37	O15354	613 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PRMT3	O60678	531 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MED26	O95402	600 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	GBA	P04062	536 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	G6PD	P11413	515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	DRD2	P14416	443 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SDC1	P18827	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PRPS1L1	P21108	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	IL10	P22301	178 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CERS1	P27544	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	DIO3	P55073	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CLDN8	P56748	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	TAS2R50	P59544	299 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	KLC1	Q07866	573 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807		Q0VFX4	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SQLE	Q14534	574 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	TLR1	Q15399	786 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	GPR180	Q86V85	440 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MIER2	Q8N344	545 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	C8orf44	Q96CB5	159 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ZBTB18	Q99592	522 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	DPY30	Q9C005	99 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MYNN	Q9NPC7	610 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	DAPP1	Q9UN19	280 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	FCHO1	O14526	889 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC22A2	O15244	555 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	LRRTM2	O43300	516 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CHST10	O43529	356 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	TMPRSS11D	O60235	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	RDH16	O75452	317 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC22A3	O75751	556 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	B3GALT4	O96024	378 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	HP	P00738	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CPN2	P22792	545 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	LIM2	P55344	173 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PER3	P56645	1201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	RAB38	P57729	211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	ARG2	P78540	354 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	C2orf80	Q0P641	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MFAP5	Q13361	173 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	RUNX2	Q13950	521 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	VWA2	Q5GFL6	755 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	AMER3	Q8N944	861 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	FAR1	Q8WVX9	515 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MTERF3	Q96E29	417 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MARK4	Q96L34	752 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	TSSK3	Q96PN8	268 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SAR1A	Q9NR31	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.62	□□□□□ -0.71
UBE2B-208	ENST00000511807	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71

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