RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 AHSA2Q719I0 299 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SPRED1Q7Z699 444 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 KIF18BQ86Y91 864 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 DPP10Q8N608 796 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 BCORP1Q8N888 145 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ITCHQ96J02 903 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC2A13Q96QE2 648 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 LHPPQ9H008 270 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 IL21Q9HBE4 155 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 IL19Q9UHD0 177 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SARDHQ9UL12 918 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PRV1 198 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFS8O00217 210 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PPEF2O14830 753 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PDE9AO76083 593 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 CDK14O94921 469 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 CD36P16671 472 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ITIH1P19827 911 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 GPX3P22352 226 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 VIPR1P32241 457 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 CXCR3P49682 368 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 KCNJ10P78508 379 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PLGLB1Q02325 96 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 NPTX1Q15818 432 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 MEP1AQ16819 746 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF404Q494X3 552 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 OR10A6Q8NH74 314 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ENKURQ8TC29 256 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PIK3R3Q92569 461 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 LINGO1Q96FE5 620 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ULBP3Q9BZM4 244 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 MMP27Q9H306 513 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 NANOGQ9H9S0 305 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 AIG1Q9NVV5 245 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SIRT5Q9NXA8 310 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 CD300AQ9UGN4 299 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 FKBPLQ9UIM3 349 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 B9A039 149 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC1A7O00341 560 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 STX16O14662 325 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 AURKAO14965 403 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 GOT2P00505 430 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 IFNA14P01570 189 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 IL6P05231 212 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ADRB3P13945 408 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PRKACAP17612 351 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 DGKAP23743 735 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 DNASE1P24855 282 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 CD68P34810 354 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 IDH2P48735 452 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 DIO3P55073 304 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB14P61106 215 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 IL11RAQ14626 422 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 UNC50Q53HI1 259 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 MED25Q71SY5 747 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 OR8J3Q8NGG0 315 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.75□□□□□ -1.81
ANKRD28-213ENST00000498524 PEX13Q92968 403 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms