RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LY6D	Q14210	128 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	C2CD6	Q53TS8	623 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	C1orf189	Q5VU69	101 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	BANP	Q8N9N5	519 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CNNM3	Q8NE01	707 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	P3H4	Q92791	437 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	C11orf52	Q96A22	123 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MOCOS	Q96EN8	888 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DEFB118	Q96PH6	123 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RCHY1	Q96PM5	261 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NACA2	Q9H009	215 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DCTPP1	Q9H773	170 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DEPP	Q9NTK1	212 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF724	A8MTY0	619 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425		A8MXK9	166 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PDHX	O00330	501 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RASGRF2	O14827	1237 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SSX5	O60225	188 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RNF224	P0DH78	156 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	OXTR	P30559	389 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CAPG	P40121	348 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CAMLG	P49069	296 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NPY2R	P49146	381 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	GMFB	P60983	142 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ERVK11-1	P61568	191 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SRPX	P78539	464 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CDKL1	Q00532	357 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	AGK	Q53H12	422 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TEX35	Q5T0J7	233 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DDI2	Q5TDH0	399 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DOK6	Q6PKX4	331 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FAM131B	Q86XD5	332 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	RDH11	Q8TC12	318 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NABP1	Q96AH0	204 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TMEM45B	Q96B21	275 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SAMD8	Q96LT4	415 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF599	Q96NL3	588 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	STRADB	Q9C0K7	418 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	LIME1	Q9H400	295 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NT5DC2	Q9H857	520 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	THYN1	Q9P016	225 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	UBE4B	O95155	1302 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	NOTCH2	Q04721	2471 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425		K7EQG2	157 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425		K7ERI5	159 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	ADAM12	O43184	909 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TSPAN2	O60636	221 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	FCER2	P06734	321 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CHRNA3	P32297	505 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	TRIM23	P36406	574 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CD86	P42081	329 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC1A6	P48664	564 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTC21B-208	ENST00000497425	CD300C	Q08708	224 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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