RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 CRCPO75575 148 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 OR6B1O95007 311 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 IGKV3-11P04433 115 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SLC35E2P0CK97 266 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 HSD3B1P14060 373 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CPMP14384 443 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 NME2P22392 152 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 HSD3B2P26439 372 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ALDH3A1P30838 453 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 PTGER1P34995 402 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SOX3P41225 446 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ALDH9A1P49189 494 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SSR4P51571 173 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 XKP51811 444 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ZNF844Q08AG5 666 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 BIKQ13323 160 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 MREGQ8N565 214 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 OR8K3Q8NH51 312 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ASB15Q8WXK1 588 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 RIT1Q92963 219 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 FBXL20Q96IG2 436 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 FRMD6Q96NE9 622 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 MECRQ9BV79 373 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 EBPLQ9BY08 206 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 MKS1Q9NXB0 559 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 HEY2Q9UBP5 337 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 MID2Q9UJV3 735 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 RAB21Q9UL25 225 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CREBBPQ92793 2442 aa6.96□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 C1orf226A1L170 272 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ASPDHA6ND91 283 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 A8MVJ9 347 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CDK2AP1O14519 115 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 TRIM13O60858 407 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 GUCY1B2O75343 617 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 UNC5CO95185 931 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CLPSP04118 112 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 IL3P08700 152 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CT62P0C5K7 136 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 NT5EP21589 574 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SSTR4P31391 388 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 RFC3P40938 356 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 MEOX1P50221 254 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 GPR85P60893 370 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 NAA20P61599 178 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 DUSP2Q05923 314 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ASPHQ12797 758 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 IMPG1Q17R60 797 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 KRT71Q3SY84 523 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SPIN4Q56A73 249 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.95□□□□□ -1.3
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PATJ-211ENST00000493967 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.95□□□□□ -1.3
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PATJ-211ENST00000493967 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 GFRALQ6UXV0 394 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SULF2Q8IWU5 870 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 NUBPLQ8TB37 319 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.95□□□□□ -1.3
PATJ-211ENST00000493967 KLHL29Q96CT2 875 aa6.95□□□□□ -1.3
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