RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 GANQ9H2C0 597 aa3.36□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.36□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.36□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.36□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 KLLNB2CW77 178 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 LRRTM2O43300 516 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SFTPBP07988 381 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 CCDC159P0C7I6 412 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 FERP16591 822 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TRADDQ15628 312 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ODF2Q5BJF6 829 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ITIH5Q86UX2 942 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 HSCBQ8IWL3 235 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 PARP8Q8N3A8 854 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 CD177Q8N6Q3 437 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 NAT8LQ8N9F0 302 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 GLYATL1Q969I3 302 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 FAM46BQ96A09 425 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 NTMT1Q9BV86 223 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 Q9HAA7 133 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ARMCX1Q9P291 453 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 FBXW2Q9UKT8 454 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.35□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TSPAN2O60636 221 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ZNF253O75346 499 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 GMNNO75496 209 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 RHBDL1O75783 438 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TXNDC12O95881 172 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SERPINF2P08697 491 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 HMGCS2P54868 508 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 GEMP55040 296 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 AARDQ4LEZ3 155 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 UNC50Q53HI1 259 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 MARC1Q5VT66 337 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 RTL6Q6ICC9 239 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 OR4F5Q8NH21 305 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 OR4L1Q8NH43 312 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 MRAPQ8TCY5 172 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 TBCKQ8TEA7 893 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 NTNG2Q96CW9 530 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 VMP1Q96GC9 406 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 CXorf58Q96LI9 332 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 RNF24Q9Y225 148 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.34□□□□□ -1.87
PTEN-204ENST00000487939 FCER2P06734 321 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 UMPSP11172 480 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 P4HA1P13674 534 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 B4GALT1P15291 398 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 HAGHQ16775 308 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 UTF1Q5T230 341 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 IYDQ6PHW0 289 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 TMEM270Q6UE05 265 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 STHQ8IWL8 128 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 RDH11Q8TC12 318 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 CAPNS2Q96L46 248 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 DESI2Q9BSY9 194 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.33□□□□□ -1.88
PTEN-204ENST00000487939 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms