RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 IMPG1Q17R60 797 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SPIN4Q56A73 249 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MDGA2Q7Z553 956 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SULF2Q8IWU5 870 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 NUBPLQ8TB37 319 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ASB15Q8WXK1 588 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZBTB9Q96C00 473 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FBXL20Q96IG2 436 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZIM3Q96PE6 472 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 RASL10BQ96S79 203 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MECRQ9BV79 373 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SENP1Q9P0U3 644 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PSME2Q9UL46 239 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.49□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 A8MVJ9 347 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SLC28A1O00337 649 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 AZIN1O14977 448 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 NME2P1O60361 137 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 NPHS1O60500 1241 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR6B1O95007 311 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CLPSP04118 112 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CHRNGP07510 517 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FGF4P08620 206 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 IL3P08700 152 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CPMP14384 443 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 DRD2P14416 443 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 NME2P22392 152 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SSTR4P31391 388 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SOX3P41225 446 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ETV4P43268 484 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SLC37A1P57057 533 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MPEG1Q2M385 716 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PIGGQ5H8A4 983 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FRMD6Q96NE9 622 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TRMOQ9BU70 441 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 EBPLQ9BY08 206 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR10A5Q9H207 317 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 HPF1Q9NWY4 346 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 HEY2Q9UBP5 337 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.48□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 OR6C76A6NM76 312 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PEX1O43933 1283 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 AGFG2O95081 481 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 UNC5CO95185 931 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 BPGMP07738 259 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 S1PR1P21453 382 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 GSTM5P46439 218 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MEOX1P50221 254 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 KCNK10P57789 538 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 DUSP2Q05923 314 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 C2orf80Q0P641 193 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MGAT2Q10469 447 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 FUT7Q11130 342 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 MAP4K2Q12851 820 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 KIAA0040Q15053 153 aa8.47□□□□□ -1.05
SYN3-211ENST00000472027 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.47□□□□□ -1.05
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