RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, human

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC13A3-208	ENST00000464518	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55	8e-12	■■■□□ 15.7
SLC13A3-208	ENST00000464518	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518		Q5PR19	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CYS1	Q717R9	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC15A4	Q8N697	577 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	NUBPL	Q8TB37	319 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ISL2	Q96A47	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAR2	Q96K12	515 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	OR4K3	Q96R72	315 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CD8B2	A6NJW9	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM107A	O95990	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCL3	P10147	92 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CREB1	P16220	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PGAM1	P18669	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC1A2	P43004	574 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF136	P52737	540 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SEC24C	P53992	1094 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC18A1	P54219	525 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	RNF4	P78317	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	LGSN	Q5TDP6	509 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	LIX1	Q8N485	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	RHBG	Q9H310	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518		G3V3Y1	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SMPD2	O60906	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CTNS	O60931	367 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	BMP7	P18075	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CTSS	P25774	331 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCSK6	P29122	969 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	NAB1	Q13506	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPM1N	Q8N819	430 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC13A3-208	ENST00000464518	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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