RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 CERS1P27544 350 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LIM2P55344 173 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 UBASH3AP57075 661 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 VLDLRP98155 873 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CTBP1Q13363 440 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SERTAD2Q14140 314 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SQLEQ14534 574 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.373e-16■■□□□ 13.3
HDLBP-222ENST00000449504 NTRK2Q16620 822 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SBSNQ6UWP8 590 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CENPUQ71F23 418 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NEUROG1Q92886 237 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NEIL2Q969S2 332 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FBXW5Q969U6 566 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IQCDQ96DY2 449 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DGAT2Q96PD7 388 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TCF12Q99081 682 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PARVBQ9HBI1 364 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TFR2Q9UP52 801 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DHRS7Q9Y394 339 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 A0A088AWK7 358 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SLC35F4A4IF30 521 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CAPN14A8MX76 684 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DYRK3O43781 588 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 C8GP07360 202 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DANCRP0C864 163 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ETS1P14921 441 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CREB1P16220 341 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PAMP19021 973 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HNF1AP20823 631 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PTNP21246 168 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MGAT1P26572 445 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PTPN6P29350 595 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 FDFT1P37268 417 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 PCYT1AP49585 367 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 NUDT6P53370 316 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 REEP5Q00765 189 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RCN2Q14257 317 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TCEAL1Q15170 157 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RPS6KA2Q15349 733 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DUPD1Q68J44 220 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 OR2A2Q6IF42 318 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 TAGAPQ8N103 731 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CD200R1Q8TD46 325 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 CAVIN3Q969G5 261 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-222ENST00000449504 UCN2Q96RP3 112 aa6.49□□□□□ -1.37
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