RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444502.5

TOP3B-210, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 4,163 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.09□□□□□ -0.79
TOP3B-210ENST00000444502 HYAL1Q12794 435 aa10.09□□□□□ -0.79
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TOP3B-210ENST00000444502 P2RY8Q86VZ1 359 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.08□□□□□ -0.8
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TOP3B-210ENST00000444502 TMEM168Q9H0V1 697 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 REEP4Q9H6H4 257 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 HSPB11Q9Y547 144 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 SPAG17Q6Q759 2223 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
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TOP3B-210ENST00000444502 SLC16A5O15375 505 aa10.08□□□□□ -0.8
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TOP3B-210ENST00000444502 CSNK1DP48730 415 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 UGT2B15P54855 530 aa10.08□□□□□ -0.8
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TOP3B-210ENST00000444502 ARMCX4Q5H9R4 360 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.08□□□□□ -0.8
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TOP3B-210ENST00000444502 NAGSQ8N159 534 aa10.08□□□□□ -0.8
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TOP3B-210ENST00000444502 TMIEQ8NEW7 156 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 NDNFQ8TB73 568 aa10.08□□□□□ -0.8
TOP3B-210ENST00000444502 PHOX2BQ99453 314 aa10.08□□□□□ -0.8
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TOP3B-210ENST00000444502 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.08□□□□□ -0.8
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