RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430853.5

TTC28-AS1-211, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 564 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EXT1Q16394 746 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SPRED3Q2MJR0 410 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SFT2D3Q587I9 215 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C6orf163Q5TEZ5 329 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAAH2Q6GMR7 532 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MRGPREQ86SM8 312 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TMEM151BQ8IW70 566 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MORN4Q8NDC4 146 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR7A2PQ8NGA2 310 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TSPEARQ8WU66 669 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RIT1Q92963 219 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MARK4Q96L34 752 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DUSP26Q9BV47 211 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 P4HTMQ9NXG6 502 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C5AR2Q9P296 337 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FRYQ5TBA9 3013 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CDC14CA4D256 554 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SAGE2PA6NJ88 616 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TAF4O00268 1085 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LAMP1P11279 417 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 COX6A1P12074 109 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TNNI3P19429 210 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RRADP55042 308 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MANFP55145 182 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NME5P56597 212 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ID2Q02363 134 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CDC20Q12834 499 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAP4K2Q12851 820 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PCOLCEQ15113 449 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PGS1Q32NB8 556 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF385BQ569K4 471 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM69BQ5VUD6 431 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PAOXQ6QHF9 649 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LANCL3Q6ZV70 420 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF675Q8TD23 568 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TEX37Q96LM6 180 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 AMDHD1Q96NU7 426 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CXorf21Q9HAI6 301 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SAR1AQ9NR31 198 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 POLHQ9Y253 713 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 A0A1W2PRB8 838 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C17orf105B2RV13 164 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 K7ENP7 123 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PLOD2O00469 737 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NDUFAB1O14561 156 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CFLARO15519 480 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NKX2-8O15522 239 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DCTN3O75935 186 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PGRP06401 933 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WT1P19544 449 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IL12AP29459 219 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KCNK10P57789 538 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 VAC14Q08AM6 782 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RCAN2Q14206 197 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAPRE2Q15555 327 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRSS53Q2L4Q9 553 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MPEG1Q2M385 716 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 AGKQ53H12 422 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SPANXN4Q5MJ08 99 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PLAG1Q6DJT9 500 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GALNT12Q8IXK2 581 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCDC116Q8IYX3 515 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 B3GNT7Q8NFL0 401 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR7G1Q8NGA0 311 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PSMA8Q8TAA3 256 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SUN3Q8TAQ9 357 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 M1APQ8TC57 530 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BCAS4Q8TDM0 211 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR5P2Q8WZ92 322 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C8orf44Q96CB5 159 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FBXL20Q96IG2 436 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IMMP1LQ96LU5 166 aa12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GLIPR2Q9H4G4 154 aa12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms