RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 LCN10Q6JVE6 187 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 SFXN5Q8TD22 340 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 NKD1Q969G9 470 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 VPS33AQ96AX1 596 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 ART5Q96L15 291 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 PTCHD1Q96NR3 888 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 IP6K3Q96PC2 410 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 SH3GL1Q99961 368 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.3□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.3□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 TTC36A6NLP5 189 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 TCN2P20062 427 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 PTPN6P29350 595 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 HBA1P69905 142 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 RETREG3Q86VR2 466 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 ZNF639Q9UID6 485 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 C3orf18Q9UK00 162 aa11.29□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 OR10H2O60403 315 aa11.28□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 ART3Q13508 389 aa11.28□□□□□ -0.6
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HDLBP-215ENST00000427487 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 C16orf89Q6UX73 402 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 DHDDSQ86SQ9 333 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 PGAM4Q8N0Y7 254 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 OR2L13Q8N349 312 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.28□□□□□ -0.6
HDLBP-215ENST00000427487 MORN4Q8NDC4 146 aa11.28□□□□□ -0.6
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