RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 CDC20Q12834 499 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 DCST1Q5T197 706 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SP140LQ9H930 580 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MKLN1Q9UL63 735 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 IFT52Q9Y366 437 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 AGAP5A6NIR3 686 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PTHP01270 115 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MAPK11Q15759 364 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CD300LDQ6UXZ3 194 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 FUZQ9BT04 418 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 AMBNQ9NP70 447 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 P2RX2Q9UBL9 471 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MYO10Q9HD67 2058 aa22.53■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 H1F0P07305 194 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CNR2P34972 360 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 NUDT6P53370 316 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 RHAGQ02094 409 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 C12orf73Q69YU5 71 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM64Q6YI46 380 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SIAEQ9HAT2 523 aa22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 A0A0A6YYD5 115 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 ANHXE9PGG2 379 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TRIM23P36406 574 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 IL12RB1P42701 662 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 CSNK1G2P78368 415 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 COX10Q12887 443 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 HTR4Q13639 388 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 NDUFA9Q16795 377 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 CYP27C1Q4G0S4 372 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 BCL2L10Q9HD36 194 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 H7BY64 318 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 ZW10O43264 779 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TMPRSS11DO60235 418 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 UPK1BO75841 260 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 ETV6P41212 452 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 GNA13Q14344 377 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 NCF4Q15080 339 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A30Q5SVS4 291 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 KRT73Q86Y46 540 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 RMI1Q9H9A7 625 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PEX16Q9Y5Y5 336 aa22.51■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 IGLON5A6NGN9 336 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TLR4O00206 839 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 B4GALT2O60909 372 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PCCBP05166 539 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 POU2F1P14859 743 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 UGT2B15P54855 530 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PERM1Q5SV97 790 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 SFXN5Q8TD22 340 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 MGLLQ99685 303 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 CDADC1Q9BWV3 514 aa22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PRQ8 180 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 CCRL2O00421 344 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 DSCR3O14972 297 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 OR1F1O43749 312 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 SH3BP5O60239 455 aa22.49■■□□□ 1.19
PMS1-205ENST00000409985 GUCY1B2O75343 617 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms