RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 WASF3Q9UPY6 502 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM131Q92545 1883 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM247A6NEH6 219 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CYR61O00622 381 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 EMC8O43402 210 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ASNA1O43681 348 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DPM1O60762 260 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PDE9AO76083 593 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GPR75O95800 540 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 AGR2O95994 175 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 B3GALT4O96024 378 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FHP07954 510 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ARAFP10398 606 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CKMT1AP12532 417 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ACADSP16219 412 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NCK1P16333 377 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GPC1P35052 558 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SOAT1P35610 550 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CRATP43155 626 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 HSPA13P48723 471 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PRIM2P49643 509 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ARSFP54793 590 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SESN3P58005 492 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ATP6AP1Q15904 470 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 C18orf63Q68DL7 685 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CBLL1Q75N03 491 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MMP21Q8N119 569 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CA13Q8N1Q1 262 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NRG4Q8WWG1 115 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PYURFQ96I23 114 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 BTBD9Q96Q07 612 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PKP2Q99959 881 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PIF1Q9H611 641 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 FANCEQ9HB96 536 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 AURKCQ9UQB9 309 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WV62 115 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 HYKKA2RU49 373 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DUXAA6NLW8 204 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN4O14493 209 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SIGLEC6O43699 453 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS23O95084 383 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CPNE6O95741 557 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 NTRK1P04629 796 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ATP1B1P05026 303 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GALNSP34059 522 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 XKP51811 444 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GFERP55789 205 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DSTNP60981 165 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ACY1Q03154 408 aa9.22□□□□□ -0.93
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