RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 RNF170Q96K19 258 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GPR27Q9NS67 375 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OR1A2Q9Y585 309 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ALG1L2C9J202 215 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 INPP4BO15327 924 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 RGS5O15539 181 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 SIGLEC6O43699 453 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GPRIN2O60269 458 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 WNT1P04628 370 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ADRB1P08588 477 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 JUPP14923 745 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 SPI1P17947 270 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ACRV1P26436 265 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 HTR1BP28222 390 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GCAP28676 217 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 NBL1P41271 181 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GPR143P51810 404 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 22.2
CS-201ENST00000351328 TNK1Q13470 666 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 NFATC4Q14934 902 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 PDK4Q16654 411 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 PERM1Q5SV97 790 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 STEAP3Q658P3 488 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OR13H1Q8NG92 308 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 PANX3Q96QZ0 392 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 MED18Q9BUE0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 SARGQ9BW04 601 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 LGR4Q9BXB1 951 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OR51B6Q9H340 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 NANOGQ9H9S0 305 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TREM2Q9NZC2 230 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 AHRRA9YTQ3 701 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TLR4O00206 839 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TCAPO15273 167 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GPR37O15354 613 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GPR39O43194 453 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 VPS4BO75351 444 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TNFRSF21O75509 655 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OTCP00480 354 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 IFNA10P01566 189 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ERVK-10P10266 1014 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 CD46P15529 392 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 MSH3P20585 1137 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 PEX2P28328 305 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 CA5AP35218 305 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 SERPINB10P48595 397 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TTPAP49638 278 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 RHDQ02161 417 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 LPAL2Q16609 132 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 DSELQ8IZU8 1212 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 COPS8Q99627 209 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 NPAS1Q99742 590 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-201ENST00000351328 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms