RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 RAB17Q9H0T7 212 aa3.46□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NMUR1Q9HB89 426 aa3.46□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa3.46□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.46□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.46□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 MEI4A8MW99 385 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 KPNA7A9QM74 516 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 FBP2O00757 339 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ARHGEF9O43307 516 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 APRTP07741 180 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 UGT1A4P22310 534 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NPY2RP49146 381 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF131P52739 623 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 FUT7Q11130 342 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 SPP2Q13103 211 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NFATC2Q13469 925 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF146Q15072 292 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 AGKQ53H12 422 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 C1orf189Q5VU69 101 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 RAET1GQ6H3X3 334 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 IRGCQ6NXR0 463 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 RNF148Q8N7C7 305 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NABP1Q96AH0 204 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 RCHY1Q96PM5 261 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ACCSQ96QU6 501 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NLNQ9BYT8 704 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ATG10Q9H0Y0 220 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 LHX3Q9UBR4 397 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 RGSL1A5PLK6 1076 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 IGLON5A6NGN9 336 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 SOCS3O14543 225 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TSPAN2O60636 221 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TRIM16O95361 564 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 FCER2P06734 321 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 PRDX2P32119 198 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ASMTP46597 345 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 SLC6A8P48029 635 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 HTD2P86397 168 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 PMP22Q01453 160 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 LY6DQ14210 128 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 PRSS33Q8NF86 280 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 OR4F5Q8NH21 305 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 PTPRUQ92729 1446 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 C18orf12Q96KH6 178 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 CAPNS2Q96L46 248 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 HPF1Q9NWY4 346 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 K7EQG2 157 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 PTMSP20962 102 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 DNAJB1P25685 340 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 GPC3P51654 580 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 MYBPC1Q00872 1141 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 PDIA5Q14554 519 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 C14orf177Q52M58 125 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 C12orf60Q5U649 245 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 IL23RQ5VWK5 629 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ASRGL1Q7L266 308 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 AMZ2Q86W34 360 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 RDH11Q8TC12 318 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 TAF4BQ92750 862 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 C14orf79Q96F83 325 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 LIME1Q9H400 295 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 DEPPQ9NTK1 212 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 MIOXQ9UGB7 285 aa3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF175Q9Y473 711 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms